实验证明，公鸡打鸣是由内在的生物钟控制的，但外在的光线和声音刺激也会诱发公鸡打鸣，但外在刺激对公鸡打鸣的影响也受公鸡内在生物钟的控制。
改变了光照和黑暗的周期时，公鸡表现出了如同人们跨大时区飞行后的时差现象。这是由于鸡的生物钟，就如同人的生物钟一样，受到夜晚时分泌的褪黑素影响。同时，公鸡打鸣和鸡的雄激素也有关，阉鸡和母鸡不会打鸣正是由于它们没有雄激素，如果给母鸡注射雄激素，母鸡也会开始打鸣。
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