农村房屋违建了十几年的处理方法如下：1、一般是由行政机关经调查取证，确认建筑物违章后，对违章搭建人作出责令停止违法行为通知书，责令其停止违法建设行为。2、违法建设拆除通知一般会要求当事人三到七个工作日自拆，会下达违法建设强拆通知，一般会在三个工作日之后。违章建筑拆除程序。1、调查询问、现场勘验。由违章建筑所在地乡、镇人民政府组织相关部门、人员进行调查询问、现场勘验（笔录、照片、测绘、相关审批材料、其它违法占地证据等），确认是否违法、违规。2、责令停止违法行为。对违章建筑确认后，由违章建筑所在地乡、镇人民政府责令停止违法行为，予以公告，限期当事人自行拆除。