医疗事故的鉴定部门是医学会。一、医疗事故鉴定哪个部门鉴定。一般医学会是医疗事故鉴定的鉴定部门。根据医疗事故处理条例的规定，设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作。二、医疗事故技术鉴定程序。医疗事故技术鉴定程序。1、当事人向卫生行政部门申请进行医疗事故鉴定。2、卫生行政部安排医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。3、专家库中随机抽取专家组成鉴定组，按照医疗卫生管理法律以及专业知识进行鉴定。