员工擅自公章私用是无效的，私人印章没有法律效力。因为印章有可复制性。用私章签订的合同，打官司的时候不被法庭认可。私用公章是违法，其行为人要承担相应的法律责任。如果其私盖公章的行为给他人造成了经济损失的，应当赔偿对方的损失；如果该行为涉嫌成立了犯罪，应当受到刑事处罚。一般情况单位对此不承担责任，但是单位对此有过错的除外。如果私用公章造成了公司的损失或者其他不利后果，则可以根据具体情况看是否属于职务侵占罪、挪用资金罪等。如果未造成严重后果的，则只能根据公司内部规章给予内部处罚。