有两个小孩的离婚时孩子抚养权的判决根据双方的具体情况而定。法律规定离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。抚养权的归属是以有利于孩子健康成长和保障合法权益为前提的。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第一千零八十四条 父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。