党组织的内部问题，特指共产党的党内。党员和党组织之间的问题处理属于党内问题。入党以后，就会有党内问题，但不是入党后党员的所有行为都属于“党内”是非问题。只有党员和党组织或其他党员之间产生党的矛盾才属于“党内的是非问题”。这些矛盾属于党的内部矛盾，而不是刑事或行政问题，应当按照《党章》的规定处理、而不能把刑事侦查的手段用来调查。比如：党员和其他组织或个人签定合同、党员违法犯罪故意杀人的，就不是党内问题，因为与党无关。