持小型汽车驾驶证驾驶校车扣十二分。持小型汽车驾驶证驾驶校车属于驾驶与准驾车型不符的行为，一旦被交警查到是需要接受相应的处罚，并处二百元以上二千元以下罚款；可以按照未取得驾驶证而驾驶机动车的处罚规定适当从轻处罚，包括处15日以下拘留等，在适用处罚上，依据过罚相当的原则，可以按照未取得驾驶证而驾驶机动车的处罚规定，适当从轻处罚。法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条。机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。第九十三条；对违反道路交通安全法律、法规关于机动车停放、临时停车规定的，可以指出违法行为，并予以口头警告，令其立即驶离。