特殊门诊一般是指符合规定大病、慢性病，在门诊治疗也可以按照住院医疗进行报销，这是因为医保主要是可对住院医疗费用进行报销，但是一些大病和慢性病等，不一定需要住院，在门诊也可以进行治疗，因此才有特殊门诊。特殊门诊病种办理流程。1、参保单位或参保个人首次申请须在每季度最后一个月15日以前，凭《医保手册》）到初审医院医保科领取表格并完整填写《特殊病种门诊申请表》，同时备齐申报病种的相关病历资料（或复印件）、一张近期1寸免冠照片，选定一家定点医院和一家特殊病种门诊服务药店就医、购药。2、初审医院收齐申请人的相应资料后，组织本院医疗专家诊查并初步鉴定。3、市医疗保险处每季季末组织本市城镇职工基本医疗保险专家委员会进行集中评审，专家委员会根据特门确认标准进行逐个审定。