二套房契税计算方法如下：1、应纳税额=计税依据×税率。2、2010年10月1日起个人购买首套普通住宅契税减半征收。3、契税税率的规定是3%-5%，一般取3%为了支持房地产业，政府对一般商品房减半收税。4、对商业用房，别墅和单价超过9324元/平米的房子收3%。5、2008年11月1日起，个人销售或购买住房暂免征收印花税，对个人销售住房暂免征收土地增值税。6、地方政府可制定鼓励住房消费的收费减免政策。二套房如果是用来居住的话，国家契税征收上是给予一定的优惠的。如果持有是用来增值的，由于国家房住不炒的原则指引下，契税负担比较大，投资还是需要谨慎的。愿每个人都能安居乐业，拥有属于自己的房子。【本文关联的相关法律依据】。《关于调整房地产交易环节契税营业税优惠政策的通知》第一条。