鳄鱼用肺呼吸。它是爬行动物的一种，没有鱼类的鱼鳃，所有只能用肺呼吸。虽然它可以潜入水中，但却不能在水里获取氧气，因此每隔一段时间就会到水面进行气体交换。它一般采用胸腹式呼吸，通过控制胸腔的扩张和缩小，从而将气体吸入或呼出，这一点和温血动物比较类似。鳄鱼为肉食性卵生脊椎类爬行动物，是两亿多年前与恐龙同时代的最古老爬行动物，也是迄今生存着的最原始动物之一。鳄鱼因强盛的生命力而生存和繁衍，成为地球上最古老的生物“活化石”之一。鳄鱼属于濒危野生保护动物，被国际上列为I类保护的濒危野生动植物。我国特产的扬子鳄被列为国家一级野生保护动物。2003年国家林业局批准了尼罗鳄(Crocodylus niloticus)、湾鳄和暹罗鳄俗称泰国鳄等3种鳄鱼列入首批54种可商业利用的野生动物。